La Mosquée d’Isa Bey fut construite en 1375 par Isa Bey, fils de Mehmet Bey, au temps de la domination des émirs d’Aydin sur Ayasoulouk.
Cette mosquée s’ouvre par un magnifique portail à stalactites surmonté de l’inscription dédicatoire. La cour était autrefois entourée de galeries couvertes par des coupoles aujourd’hui disparues. Pendant la période antique, l’emplacement de la cour avait été utilisé comme nécropole.La salle de prière est coiffée en partie par deux coupoles reposant, par l’intermédiaire d’arcs brisés, sur quatre puissantes colonnes antiques de marbre gris et rose provenant des thermes du Port et que surmontent quatre chapiteaux dont l’un est d’origine romaine.